氣調庫的進出貨和貯藏中的管理。在氣調庫進貨前應事先檢查庫房的整體情況，如檢查所有溫度探點的精度、庫體的密封性能、所有氣體取樣管道有無泄漏，以及檢查所有氣體分析儀器和控制器的能否正常工作。貨物人庫存前還應用無毒、無害、無腐蝕性的液體清洗或熏蒸庫房和貯藏盛放容器來進行消毒，也可用臭氧或紫外光進行。為保證貨物能整齊有序地堆放，可事先根據果蔬盛放物的尺寸，在地坪上規劃好堆放位置。然后進行空庫降溫，以預先排除圍護結構的蓄熱，減少果蔬入庫后總的熱負荷，均衡冷卻設備的負擔，以利于制冷系統的安全運行。
果蔬運抵后應進行挑選，將傷殘的、次的和有蟲的剔除，然后應盡可能快地讓其入庫，單間氣調庫的入庫時間應控制在3一5天，最長不能超過7天。在裝貨期間應隨時檢查裝貨的均勻及裝滿程度，并將溫度探點均布在整個庫房中。裝滿后，關門降溫，等到庫溫和果蔬的溫度基本達到貯藏溫度時，開始封庫貯藏。同時，開始降氧操作，考慮到降氧的同時也應使二氧化碳的濃度盡快升到最適濃度，要依靠果蔬的呼吸來增大庫內的二氧化碳濃度，因此在封庫降氧時，不必將庫內的氧氣濃度一下降到要求濃度，而應比要求濃度高2%~3%，再利用果蔬的呼吸來消耗掉這部分過量氧氣。
按照氣調貯藏的要求，果蔬貯藏期間溫度波動的范圍應控制在0.5℃以內，氧氣、二氧化碳濃度變化也應控制在0.5%以內，乙烯濃度控制在允許值以下，相對濕度應保持在90%~95%。貯藏期間應每月兩次對果蔬取樣檢查。
根據市場需要，果蔬要出貨時，要事先做好開庫前的準備工作。為誠少低氧對工作人員的危害，在出庫前要提早24h解除氣密狀態，停止氣調設備的運行，并
通過自然換氣的方法使庫內氣體恢復到空氣成分。當庫門開啟后，要十分小心，在確定庫內空氣為安全值前，不允許工作人員進入。對于氣調庫而言，經營方式以批發為主，每次的出貨量最好不少于單間氣調庫的貯藏量，做到開一間，銷一間。
盡管氣調庫在諸多方面有其獨特的要求，造價也高于高溫庫，但由于其良好的果蔬貯藏效果，仍受到世界各地的普遍歡迎，在我國也有廣闊的應用前景。
