1.分層凍結對于多聯的凍干制品，為了防止制品相互干擾而影響質量，或者溶解后的溶液的共熔點溫度低于組成這一溶液的單獨組分的溫度，可采用在特殊的裝置中分層凍結，即在瓶中先裝一種溶液進行凍結，待凍結后再裝進另一種溶液凍結。如果在裝進第二種溶液時會使已凍的第一種溶液熔化而影響質量，則可在這兩種溶液之間裝一層惰性材料，將兩種溶液分隔開。采用這種凍結方法往往將共熔點溫度低的一種溶液后裝。雖然這種凍結手續麻煩，但使用很方便，可節省安瓿、包裝材料，減少封口次數和運輸，但復水后一般要立即使用。
2.反復凍結此法適用于某些共熔點溫度較低，或結構比較復雜的粘稠制品，如蜂蜜、蜂王漿等。這些產品在升華過程中，往往凍塊會軟化，而產生氣泡，并在制品表面形成粘稠狀的網狀結構，從而影響升華干燥和產品外觀。為了保證產品干燥順利進行，可用反復凍結法凍結。例如，某制品共熔點為一25℃，可先將制品速凍到一45℃左右，然后將制品升溫到共熔點附近（如一27℃），維持30~40min，再將溫度降至一40℃左右，如此反復處理，使制品晶體結構改變，制品表層外殼由致密變為疏松，以利于水分的升華逸出。
3.粒狀凍結將溶液用吸管吸出后滴入液氮中，從水珠中逸出的氣體會使它浮在液氮表面附近，直到凍結后才沉入底部，呈均勻小尺寸（直徑約4mm）的球狀。將其放入盤子中，盤底加熱升華，靠近盤底的小丸逸出的氣體容易形成一個懸浮氣體床，把熱量傳給上部的小丸，小丸還會上下移動，已干的丸子因較輕而升至上面，未干的移至下面，因此小丸的凍干速度要比相同體積的薄片快得多。
