庫內堆垛嚴格按照倉庫規章進行，合理選擇貨位。將長期存貨放在庫里端，短期存貨放在庫門口附近，易升溫的貨物存放在接近冷風口或者排管附近。根據貨物或者包裝形狀合理采用垂直疊垛或者交叉疊垛。貨垛要求堆碼整齊、貨垛穩固、間距合適。貨垛不能堵塞或影響冷風的流動，避免出現冷風短路。
堆垛間距要求：低溫冷凍庫貨垛距頂棚0.2米，高溫冷藏庫貨垛距頂棚0.3米；距頂排水管下側0.3米；距頂排水管橫側0.3米；距未裝設墻冷排管的墻壁0.2米；距冷風機周圍1.5米。
拆垛作業時，應當從上往下取貨，禁止垛中取貨。取貨時要防止因貨物凍結黏連強行取貨而損壞包裝。
