1)為維持低相對濕度的空氣環境，干燥室的空氣處理設備所耗費的冷量與熱量，通常比一般性的除濕處理要大數倍，因此系統內各個構件及除濕方式的選擇，均應考慮節能。如系統內存在高、低溫差時，盡可能采用換熱器進行熱回收，以降低整個系統的運行費用。
2)如果系統的氣密性不佳，有室外空氣通過空氣處理設備、風管或者干燥室的圍護結構滲入系統，則很難維持干燥室內低空氣含濕量的要求。為除去由于室外空氣滲入所帶來的額外濕負荷，降濕裝置的容量要增大，造成初投資與運行費用增加。因此，系統的氣密性應高度重視，系統安裝完畢后，應對整個系統進行檢漏。
3)由于干燥室內的空氣相對濕度很低，容易產生靜電，對許多生產設備產生不利影響，所以干燥室內通常應采用防靜電地板等其他一些防靜電措施。
4)為使系統正常運行，需對除濕機的除濕能力進行控制。對于除濕轉輪，其除濕能力(除濕機出口空氣的含濕量)隨入口空氣速度、入口空氣含濕量、入口空氣溫度、再生空氣入口溫度等許多因素有關，但通常采用除濕機的入口空氣溫度控制與再生空氣溫度控制的自動控制方法。
