冷凝器運行過程中，進水閥、出水閥、進氣閥、出液閥、均壓閥、安全閥前的截止閥和液面指示器的閥門必須全開，放油閥和放空氣閥應關閉。冷凝器停止工作時，應首先關閉進氣閥，間隔一段時間后，再切斷水泵和風機的電源，停止供水。冬季停用應將水冷冷凝器中的積水放凈。若冷凝器長時間停用，必須將制冷劑排空，并與其他管路隔開。
冷凝器運行維護的一般要求。
a.冷凝壓力一般不超過1.5MPa。
b.經常檢查冷卻水的供應情況或風機的風量情況，保證水量或風量足夠，分配均勻。
c.冷凝器的進出水溫差應根據其種類調整，蒸發式冷凝器通常控制在8~14℃，立式和淋激式為2~3℃，臥式為4~6℃，冷凝溫度較出水溫度高3~5℃。
d.對于氨系統，應定期采用化學分析法或酚酞試紙檢驗冷卻水是否含氨，以確定冷凝器是否漏氨，一般每月一次，發現問題及時處理。
e.對于氨系統，應根據壓縮機耗油量的多少定期進行系統放油，一般每月一次。并根據冷凝溫度、壓力及水溫、空氣溫度情況分析是否需要放空氣。
f.根據水質情況，定期除水垢，水垢厚度一般不得超過1.5mm，一般一年清除一次。
g.蒸發式冷凝器運行時，應先開啟風機，然后開啟循環水泵，再開啟進氣閥和出液閥。噴水嘴應暢通，定期清除水垢。
