冷藏貨艙的制冷方式有桶泵供液方式、直接膨脹供液方式和間接冷卻制冷三種。較大漁船一般采用桶泵供液，其制冷效果較好。直接膨脹供液方式是制冷劑在冷卻排管內直接吸收冷藏通內的熱量，其熱量的傳遞是依靠艙內空氣的對流作用完成的。直接冷卻按照空氣的對流情況不同，又有直接盤管冷卻和直接吹風冷卻兩種，前者艙內空氣為自然對流，后者為強迫對流。強迫對流冷卻的冷卻效果高，艙內降溫速度快，艙溫分布均勻，但其能耗較大，運行費用增加，并且干耗增加。
間接冷卻中制冷劑在鹽水冷卻器內先冷卻鹽水(即載冷劑)，然后通過鹽水循環和把低溫鹽水送至冷藏駿內的蒸發盤管，實現冷藏艙的降溫，冷藏艙的降溫是通過鹽水吸熱完成的，相對制冷劑而言，它是間接獲得熱量的。
冷藏艙的蒸發盤管一般都是采用光滑無縫管，通常以排管組形式布置在冷藏艙艙壁和頂板。一般高溫冷藏能不設攻發排管而采用冷風機，漁船冷藏艙一般設置3~5艙不等。
